普陀区博物馆所在地沈家门是全国著名渔港，与挪威的卑尔根港、秘鲁的卡亚俄港合称世界三大渔港。全馆展览的主题为“渔都风情展”，以沈家门渔港为主体，从渔、港、景三方面展示普陀区域文化和渔都风情、风貌。
为充实藏品内容，提高博物馆展示品位，区博物馆根据本馆的性质和特点，结合已制定的藏品征集计划，对现存藏品构成中的薄弱环节予以丰富和完善。征集范围包括普陀民俗文化、渔业生产工具、渔民生活习俗用品及有一定收藏价值的藏品和艺术品等；征集方式以购买和接受社会各界捐赠为主，购买方式以下乡摸底、通过业余文保员提供线索等方式进行；截止目前共征集藏品14件（套），其中接受捐赠的有2件（套），分别为汉代和民国的生活用品；购买的藏品有元代、清代及民国的渔业公所、商家店铺、婚庆用品等。